Profilage omics complet des substances volatiles et des acides gras rares

La chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS) a maintenu une proportion constante d'articles sur la métabolomique publiés chaque année. Une augmentation régulière du nombre de rapports métabolomiques pour la LC-MS s'est accompagnée d'une diminution du phénotypage métabolique basé sur la RMN au cours des 10 dernières années. Quelle est la raison de ce succès de la GC-MS ?

Tout d'abord, la CL peut analyser à la fois les composés volatils à température ambiante et ceux qui restent stables jusqu'à leur point d'ébullition. Bien que les composés volatils classiques tels que les terpènes restent le domaine exclusif de la CPG-MS, un nombre étonnamment élevé de composés présentent une stabilité thermique élevée permettant de les analyser par cette technique sans aucune dérivatisation supplémentaire. UC Davis continue d'utiliser la CPG-TOFMS pour le profilage du métabolisme primaire avec des dérivatisations en deux étapes, désormais dotée de la dernière innovation, l'instrument Pegasus BTX. Cependant, nous avons également élargi notre portefeuille en mesurant une gamme de composés volatils qui peuvent être globalement classés en composés volatils à température ambiante (nécessitant des techniques de piégeage) et en composés volatils ayant des points d'ébullition supérieurs à celui de l'hexane (permettant des injections de liquides).

Ici, nous nous concentrons sur un avantage supplémentaire des techniques de CP par rapport à la CL-SM, à savoir la résolution chromatographique totale supérieure due au nombre total de plateaux théoriques (avec ou sans séparations 2D). Avec des colonnes très longues, un grand nombre d'isomères peuvent être séparés avant la détection par SM. Par exemple, les microbes intestinaux humains ont la capacité de produire une vaste gamme de lipides peu communs, allant des sulfonolipides et des FAHFA aux acides gras contenant du cyclopropane. Ces composés ont des formules identiques à celles d'isomères, ce qui nécessite des colonnes de 60 m pour distinguer des mélanges complexes dans des études sur le régime alimentaire humain, telles que celles menées avec des amandes.

Deuxièmement, nous montrerons comment la solution de LECO spectromètre de masse GC-TOF de paillasse permet d'étudier les interactions sociales au sein des ruches d'abeilles, en distinguant les profils de signalisation chimique entre reines, faux-bourdons, nourrices et butineuses. Comme nombre de ces types de composés ne peuvent pas être ionisés par ionisation par électrospray, les techniques de CPG-SM ont de beaux jours devant elles et prospèrent dans l'analyse de mélanges complexes !